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數(shù)字育種顯身手

2025-05-20 09:39 來(lái)源:經(jīng)濟(jì)日?qǐng)?bào)
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(責(zé)任編輯:朱曉倩)
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數(shù)字育種顯身手

2025年05月20日 09:39   來(lái)源:經(jīng)濟(jì)日?qǐng)?bào)   劉 成

  位于青島高新區(qū)的山東極智生物科技有限公司實(shí)驗(yàn)室內(nèi),技術(shù)人員用超薄切片機(jī)處理一片植物根尖樣本,,肉眼難辨的根尖組織截面圖在顯示屏上呈現(xiàn)層層疊疊的彩色網(wǎng)格,像一幅抽象派油畫,。

  “這是空間條形碼芯片,,每一個(gè)點(diǎn)對(duì)應(yīng)組織的一個(gè)坐標(biāo)點(diǎn),用來(lái)檢測(cè)基因在染色體上的空間位置和信息,。切片后,,RNA(核糖核酸)會(huì)帶著‘地址標(biāo)簽’進(jìn)入測(cè)序儀,還原出基因表達(dá)在空間上的‘熱力圖’,�,!睒O智生物技術(shù)員潘宏偉告訴記者,這種時(shí)空轉(zhuǎn)錄組切片技術(shù)處于行業(yè)領(lǐng)先水平。

  作為基因檢測(cè)領(lǐng)域的高新技術(shù)企業(yè),,極智生物主要從事數(shù)字育種CRO(合同研發(fā)組織)服務(wù)及高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)+耐逆+抗病小麥新品種創(chuàng)制研發(fā),。“公司基于自主搭建的功能基因位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù),、先進(jìn)的基因檢測(cè)技術(shù)平臺(tái),、AI驅(qū)動(dòng)的精準(zhǔn)育種預(yù)測(cè)算法以及快速繁育平臺(tái),為科研機(jī)構(gòu)和種企提供‘基因型體檢—最優(yōu)親本組配—快速純合—GS(全基因組選擇育種)品種早期選擇’的精準(zhǔn)育種解決方案,,助力育種企業(yè)縮短育種周期,、降低育種成本、提高育種效率,�,!睒O智生物總經(jīng)理徐鳳鳳介紹。

  瞄準(zhǔn)行業(yè)難題,,極智生物持續(xù)開(kāi)展技術(shù)攻關(guān),。“以時(shí)空轉(zhuǎn)錄組切片技術(shù)為例,,樣本處理環(huán)節(jié)困難重重,。”潘宏偉說(shuō),,植物組織的結(jié)構(gòu)復(fù)雜,,不同細(xì)胞類型和組織層次緊密相連,在切片過(guò)程中極易造成組織變形,、RNA降解等問(wèn)題,,嚴(yán)重影響后續(xù)基因表達(dá)信息的準(zhǔn)確獲取。為此,,技術(shù)團(tuán)隊(duì)進(jìn)行了上百次實(shí)驗(yàn),,嘗試多種切片方法和樣本固定液配方,最終找到一種能夠最大程度保持組織形態(tài)完整,、減少RNA降解的處理方案,。

  時(shí)空轉(zhuǎn)錄組切片技術(shù)的成功應(yīng)用,使科研人員能夠深入了解植物基因在不同組織和發(fā)育階段的表達(dá)模式,�,!袄纾谘芯啃←湋�(yīng)對(duì)干旱脅迫時(shí),,通過(guò)該技術(shù)可以精準(zhǔn)定位到哪些基因在根部的特定區(qū)域表達(dá)上調(diào)或下調(diào),,從而為培育耐旱小麥品種提供理論依據(jù)�,!迸撕陚フf(shuō),。

  數(shù)據(jù)處理和分析也是極智生物重點(diǎn)研發(fā)的方向,。“海量的基因數(shù)據(jù)如同雜亂無(wú)章的信息海洋,,如何從中快速準(zhǔn)確地篩選出與育種相關(guān)的關(guān)鍵信息,,以及如何將基因數(shù)據(jù)與傳統(tǒng)育種表型數(shù)據(jù)有效整合,都是需要破解的難題,�,!迸撕陚フf(shuō)。

  為此,,極智生物組建了一支包括生物信息學(xué)專家,、數(shù)據(jù)科學(xué)家和育種專家在內(nèi)的跨學(xué)科團(tuán)隊(duì),自主開(kāi)發(fā)了一套數(shù)據(jù)預(yù)處理和分析流程,,利用先進(jìn)的數(shù)據(jù)挖掘算法和機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù),,能夠高效地從海量基因數(shù)據(jù)中提取關(guān)鍵信息,并將其與表型數(shù)據(jù)進(jìn)行深度融合,。

  在不斷實(shí)踐中,,極智生物逐步完善基因檢測(cè)技術(shù)平臺(tái)和AI育種預(yù)測(cè)算法,推動(dòng)育種過(guò)程更加精準(zhǔn)化和智能化,�,!案鶕�(jù)基因檢測(cè)結(jié)果,企業(yè)對(duì)育種材料進(jìn)行精準(zhǔn)篩選,,避免了傳統(tǒng)育種中大量的盲目試錯(cuò)過(guò)程,。以前,培育一個(gè)新品種可能需要8年至10年,,現(xiàn)在借助新技術(shù),,育種周期可以縮短至3年至5年,育種成本降低約30%至50%,�,!毙禅P鳳說(shuō)。

  種子是農(nóng)業(yè)的“芯片”,,技術(shù)研發(fā)能力是核心競(jìng)爭(zhēng)力,。“我們努力通過(guò)整合各方面資源,,建立一個(gè)全鏈條系統(tǒng)化工程化的育種系統(tǒng)�,!毙禅P鳳說(shuō),,公司將積極推進(jìn)高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)+耐逆+抗病的小麥突破性新品種創(chuàng)制工作以及優(yōu)良底盤品種的快速定向改良工作,力爭(zhēng)通過(guò)2年至3年的時(shí)間,,完成多個(gè)優(yōu)良基因聚合的小麥品種培育,。(本文來(lái)源:經(jīng)濟(jì)日?qǐng)?bào) 作者:劉 成

(責(zé)任編輯:朱曉倩)

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