科技日報(bào)訊?。ㄓ浾邚垑羧唬┟绹M菄裔t(yī)療中心在最新一期《自然·通訊》上發(fā)表文章稱,他們“繪制”了一種創(chuàng)新細(xì)胞圖譜,,首次揭示了癌癥進(jìn)化中一個(gè)極其關(guān)鍵角色——“染色體外DNA”(ecDNA),,其可預(yù)測突變的致癌基因如何重塑DNA結(jié)構(gòu),進(jìn)而改變腫瘤微環(huán)境,。這項(xiàng)成果為未來精準(zhǔn)醫(yī)療發(fā)展奠定了重要基礎(chǔ),,有望為癌癥患者提供更個(gè)性化,、更具針對性的治療方案。
過去十年間,,科學(xué)界逐漸認(rèn)識到一種曾被忽視的遺傳物質(zhì)——染色體外的小型DNA分子在癌癥發(fā)展中的關(guān)鍵作用,。這些ecDNA的環(huán)狀結(jié)構(gòu)違反了傳統(tǒng)生物學(xué)規(guī)律,成為驅(qū)動癌癥發(fā)生與演化的強(qiáng)大引擎,。
新研究揭示了不同ecDNA之間相互作用的新機(jī)制,。更重要的是,當(dāng)ecDNA與某些致癌因子(如EGFR蛋白或腫瘤抑制蛋白p53)共同存在時(shí),,會引發(fā)腫瘤微環(huán)境的缺氧狀態(tài),,而這種低氧環(huán)境與癌癥進(jìn)展、治療耐藥性以及臨床不良預(yù)后密切相關(guān),。
此次研究結(jié)合了空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)(對DNA活性進(jìn)行測量與圖譜繪制)和基因組數(shù)據(jù),,成功識別出源自同一祖先但獲得額外突變的不同細(xì)胞群落。這些細(xì)胞的空間分布圖,,有助于揭示腫瘤的演化路徑,。這一系列新發(fā)現(xiàn)為精準(zhǔn)醫(yī)療研究提供了堅(jiān)實(shí)的數(shù)據(jù)支撐,推動了創(chuàng)新技術(shù)應(yīng)用,,從而實(shí)現(xiàn)更優(yōu)療效,、更低副作用的治療目標(biāo)。
團(tuán)隊(duì)通過對少量膠質(zhì)瘤樣本(發(fā)生在大腦或脊髓中的腫瘤)進(jìn)行批量RNA測序,、腫瘤/正常DNA測序及空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,,識別出腫瘤微環(huán)境中的共性特征與獨(dú)特模式,構(gòu)建出了這個(gè)可供其他科研團(tuán)隊(duì)參考的整合分析框架,。
現(xiàn)階段研究主要聚焦于幾種類型的腦癌,,但所展示的空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法和基因組測序技術(shù),有朝一日將廣泛應(yīng)用于各類癌癥的個(gè)體化治療中,。
團(tuán)隊(duì)表示,,癌癥及其治療從來不是“一刀切”的問題。理解ecDNA在可遺傳與非遺傳細(xì)胞附近的分子行為,,有助于揭示潛在的治療靶點(diǎn),,并可評估癌癥復(fù)發(fā)的風(fēng)險(xiǎn)。