
7月27日,2018生物科技與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)國(guó)際高峰論壇在京舉辦,。圖為斯坦福大學(xué)干細(xì)胞生物學(xué)和再生醫(yī)學(xué)研究所病理學(xué)副教授Marius Wernig作主題演講,,題目為《重組的轉(zhuǎn)化應(yīng)用》。 經(jīng)濟(jì)日?qǐng)?bào)-中國(guó)經(jīng)濟(jì)網(wǎng)記者張相成/攝
經(jīng)濟(jì)日?qǐng)?bào)-中國(guó)經(jīng)濟(jì)網(wǎng)北京7月27日訊 由中國(guó)產(chǎn)學(xué)研合作促進(jìn)會(huì)主辦,,賽爾集團(tuán)等承辦的“2018生物科技與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)國(guó)際高峰論壇”今日在京舉辦,。
斯坦福大學(xué)干細(xì)胞生物學(xué)和再生醫(yī)學(xué)研究所病理學(xué)副教授Marius Wernig在主題演講中介紹了細(xì)胞重組的轉(zhuǎn)化和應(yīng)用,如何利用細(xì)胞實(shí)現(xiàn)葡萄糖的運(yùn)輸,,用以了解人類的基因工作機(jī)理以及基因如何突變的,,以及導(dǎo)致老年癡呆癥和帕金森癥的原因。
以下為演講全文:
謝謝主辦方的邀請(qǐng),,謝謝你們的聆聽,。這是一個(gè)特別的活動(dòng),我很高興來(lái)到這里,,我也很感激你們能夠作出這樣的努力,,尤其是感謝中國(guó)的這種努力,促進(jìn)科學(xué),、促進(jìn)醫(yī)學(xué)的發(fā)展,,尤其是促進(jìn)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)的發(fā)展。我相信這個(gè)領(lǐng)域應(yīng)該是有很廣闊的前景。事實(shí)上今天早上我們也意識(shí)到中國(guó)這個(gè)國(guó)家它的偉大之處,、卓越之處,。中國(guó)古代修建了像故宮這樣精美的建筑�,?梢钥闯鲈谥袊�(guó)各個(gè)領(lǐng)域,,不只是醫(yī)學(xué)以及建筑都有它的專長(zhǎng)。大部門的聽眾是講英文的,,所以我也幾句中文吧,。“你好”,。
下面我開始演講,。
在很久之前我們知道這種發(fā)展被稱為是單向的,像胚胎大部分的發(fā)展要成熟,,由胚胎細(xì)胞分化為不同類型的細(xì)胞,,最后在我們成人體內(nèi)可以看到細(xì)胞不斷成熟。但是都認(rèn)為細(xì)胞分化是單向的,,但是由于不同的編碼編程以及不同的組合的經(jīng)驗(yàn),,可以把一個(gè)完全成熟的細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)化,回到它的原始狀態(tài),,這就是我們首先要分享的內(nèi)容,,我們所說(shuō)的細(xì)胞和它的研究。
之前也有克隆的研究,,我相信大家都看過(guò)這張幻燈片,,東京大學(xué)的教授認(rèn)為一些轉(zhuǎn)錄的因素可以幫助我們把細(xì)胞轉(zhuǎn)化為和胚胎干細(xì)胞非常類似的細(xì)胞。因此我們就在想,,這種直線性的發(fā)展,,我們要考慮到這些細(xì)胞之間的關(guān)系,或者說(shuō)我們把一個(gè)非常成熟的狀態(tài)的細(xì)胞,,假如說(shuō)成人細(xì)胞如何把它回歸到原始的胚胎細(xì)胞的狀態(tài),,這是非常精彩的現(xiàn)象。我相信我們可以利用這張圖進(jìn)一步的闡述,,如何把一個(gè)成熟的成人細(xì)胞轉(zhuǎn)化成為原始的狀態(tài),。今天早上也分享了如何把纖維元細(xì)胞變?yōu)樯窠?jīng)元細(xì)胞,在這些方面我們非常成功,。我們認(rèn)為誘導(dǎo)神經(jīng)元細(xì)胞是從纖維元細(xì)胞中獲得的,,直接變?yōu)樯窠?jīng)元細(xì)胞。今天托馬斯也分享了在實(shí)驗(yàn)室不斷的研究,,可以看到這些細(xì)胞是利用了不同的標(biāo)記物標(biāo)記出來(lái)的,,這些細(xì)胞也有自己非常強(qiáng)的生理學(xué)特性,它們也可以接收到我們這些突出物所呈現(xiàn)出來(lái)的信號(hào),,這就是神經(jīng)元的獨(dú)特之處,。
設(shè)想如何從病人身上找到一些樣本?我們把這些細(xì)胞進(jìn)行重組,從IPS可以把它們直接進(jìn)行組合,,利用這些細(xì)胞實(shí)現(xiàn)葡萄糖的運(yùn)輸,。帕金森癥的一些患者主動(dòng)加入了我們的研究,今年早上托馬斯也分享了,,我們希望能夠了解人類的基因工作機(jī)理以及基因如何突變的,,如何會(huì)導(dǎo)致這些老年癡呆癥以及帕金森癥,。
我們思考這個(gè)問(wèn)題從何而來(lái),?這是一個(gè)非常積極的項(xiàng)目。我們希望能夠進(jìn)一步的思考,,找到這種結(jié)果,。如何能夠?qū)崿F(xiàn)這種轉(zhuǎn)換,從一個(gè)不同的細(xì)胞類型,、纖維元細(xì)胞轉(zhuǎn)化為神經(jīng)元細(xì)胞,,他們本來(lái)沒(méi)有什么關(guān)系,這是轉(zhuǎn)錄的因素,,叫做Ascl1,,這是一個(gè)非常基本的換,,從Helix可以找到它的轉(zhuǎn)錄因素,。這些因素一般來(lái)說(shuō)是可以把不同的鏈整合在一起。我們要問(wèn)的第一個(gè)問(wèn)題是:Ascl1在纖維元細(xì)胞組中處在哪個(gè)位置,,纖維元細(xì)胞一旦呈現(xiàn)出來(lái)的時(shí)候,,我們希望找到它的基因組,它的基因阻在哪個(gè)部分,,基因組中SCRE在哪個(gè)地方呢,?我們可以看到這個(gè)基因組在這里有一個(gè)熱圖,我們利用IP序列的方式找到他的熱圖,,在MEFs以及BAM方面它的特征跟NPCs是一樣的,,也就是說(shuō)這些基因的目標(biāo)是非常開放的,是在纖維元細(xì)胞當(dāng)中可以找到的,,或者說(shuō)我們可以找到Ascl1,,纖維元細(xì)胞里面可以找到相似的細(xì)胞組行,這是它的轉(zhuǎn)錄里面非常相似的類型,,就是它的這種染色質(zhì)是如何整合在一起的,。為了把他們區(qū)分他們是開放的,讓你可以找到這些基因序列,。到底我們?cè)趺礃幽軌蛟谶@個(gè)過(guò)程中進(jìn)行分別,,尤其是在表達(dá)之前可以進(jìn)行區(qū)分。首先是經(jīng)過(guò)處理,,還有再目標(biāo)的基因分子,�,?催@周圍兩者相聚比較近,這是科學(xué)上的表述,。也就是說(shuō)他們的DNA在核附近,,做這個(gè)附近意味著他們沒(méi)有辦法轉(zhuǎn)錄,是封閉的,,這是非常重要的一點(diǎn),。只有一部分的轉(zhuǎn)錄因子是存在,也知道他們可以實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄,,他們被稱之為先鋒因子,。所以我們知道Ascl1指的是有相應(yīng)的靶向先鋒因子的。
在目標(biāo)的方面,,可以看出有一些差異的存在,,一旦表達(dá)了出來(lái),就可以開放性的表達(dá),,這個(gè)區(qū)域?qū)ζ渌D(zhuǎn)錄的區(qū)域是開放,,對(duì)于其他染色質(zhì)的建模都成為了可能性,我們希望通過(guò)這種方式更好地了解,,并且衡量實(shí)際所發(fā)生的狀況,。為了能夠做到這一點(diǎn),把我們的方法進(jìn)行了一定的優(yōu)化,。我們的方法叫做ATAC-seq,,把這個(gè)染色質(zhì)開放又關(guān)閉,這個(gè)開放可以了解整個(gè)發(fā)展進(jìn)程的變化,�,;蛘呤菑腄NA的階段出現(xiàn)。這里藍(lán)色所展示就是我們這個(gè)TM-5,,其實(shí)是我們秩序的指引物,,而我們的Chromatin一旦進(jìn)入核的區(qū)域就沒(méi)有辦法進(jìn)行融合了。我們把這個(gè)方法應(yīng)用到一系列的重要的結(jié)合點(diǎn),,這個(gè)結(jié)合點(diǎn)也顯示出染色質(zhì)動(dòng)態(tài)的變化,。在圖中黑色的曲線所代表的區(qū)域,如果出現(xiàn)了lttTA是有基本的信號(hào),,但是如果說(shuō)我們?cè)诮?jīng)過(guò)了12個(gè)小時(shí)之后,,我們的這個(gè)信號(hào)就會(huì)極大的提升,而且是非常明顯的,,而且是開放式的,,大家可以在圖中看到這個(gè)信號(hào)不斷增加,在整個(gè)轉(zhuǎn)錄過(guò)程中這個(gè)信號(hào)是在快速增加的。紅色是不同的效率,,離染色質(zhì)比較近,。在這一塊經(jīng)過(guò)五天之后,明顯可以發(fā)現(xiàn)這個(gè)數(shù)值的變化還是比較大的,。也就是說(shuō),,在兩邊有兩個(gè)核的區(qū)域。這個(gè)核的區(qū)域正好就在中心的兩邊,。因此,,一個(gè)單一轉(zhuǎn)錄的區(qū)域是如此的漂亮,他們有著直接的靶向區(qū)域,,從一開始的時(shí)候是更加隨機(jī)的分配的模型,,接著逐漸轉(zhuǎn)化到了更加高結(jié)構(gòu)化的架構(gòu),在這里給大家展示的數(shù)據(jù)也有類似的觀點(diǎn),。
基于顏色密度不同,可以看到這個(gè)顏色之間出現(xiàn)的分辨率的情況,,在這里我不想浪費(fèi)大家的時(shí)間沒(méi)有辦法講特別細(xì),,但是我想讓大家可以看一下,這兩張圖其實(shí)是有所不同的,。因?yàn)樵谶@里有兩朵云,,第二朵云這兩邊就更平一些,這就是我們所謂的第二個(gè)細(xì)胞核的層,,而且跟第一層會(huì)有著一定的重疊,。
剛才給大家展示了都是一些其他的數(shù)據(jù),這都是從靶向,、目標(biāo)的角度來(lái)思考的,。基因?qū)W當(dāng)中可以分析,,如果改變基因其他方面會(huì)帶來(lái)怎樣的影響,?對(duì)于所有基因科學(xué)家來(lái)說(shuō),因?yàn)槲覀兊幕騾f(xié)會(huì)是面向開放的,,我們就能夠看到有很多的變化已經(jīng)出現(xiàn)了,。最上面的區(qū)域密度是比較大,還有一些平均密度比較高的區(qū)域正在關(guān)閉,,而其他的區(qū)域卻并非如此,。這其實(shí)是因?yàn)槲覀兗せ盍怂霓D(zhuǎn)錄因子,我們到底應(yīng)該怎么樣決定什么時(shí)候應(yīng)該關(guān)閉,,最重要的是我們可以看一下目前沒(méi)有非常明確的機(jī)制,,我們必須依靠?jī)?nèi)部的方法和工具,包括一些通用的效果和方法來(lái)實(shí)現(xiàn)這一點(diǎn)。
我們做發(fā)現(xiàn)的另外一個(gè)驚奇,。做調(diào)查的時(shí)候可以看到對(duì)不同的情況,,從0到220,在這個(gè)過(guò)程中可以看到隨著地點(diǎn)的放開,,這些變化不是漸進(jìn)式的,,這里實(shí)現(xiàn)的是兩天到五天時(shí)間非常性的提升。我們的整個(gè)轉(zhuǎn)錄過(guò)程其實(shí)也是逐漸所產(chǎn)生的,。而且,,是需要我們進(jìn)行緩慢的安排。在我們的過(guò)程中出現(xiàn)了非�,?焖�,、明顯的轉(zhuǎn)化,就像我們?cè)诮R粯拥�,。我們可以看到,,有比較小的一些調(diào)整,這些調(diào)整是對(duì)序列的調(diào)整,。這對(duì)于我們來(lái)說(shuō)是非常驚訝的,。
第二天和第五天的時(shí)候,是在逐漸的成熟化的轉(zhuǎn)換過(guò)程中,。在這里給大家展示了一些照片和例子,,比如說(shuō)在第二天的時(shí)間這里給但是展示一個(gè)時(shí)間軸,可以看到在我們通過(guò)控制,、對(duì)照的過(guò)程來(lái)進(jìn)行一些區(qū)分,,沒(méi)有邊組的過(guò)程。到第五天產(chǎn)生了更加巨大的變化,。從細(xì)胞生物學(xué)的角度來(lái)看,,大部分的變化都是后期產(chǎn)生的,都是需要有相應(yīng)的設(shè)計(jì),,我們?cè)谝婚_始的時(shí)候不需要期待有太多的變化,,但是實(shí)際上在最后我們的變化是逐漸累計(jì)而成的。很遺憾沒(méi)有特別多的時(shí)間給大家介紹另外一個(gè)轉(zhuǎn)錄的流程,,這個(gè)轉(zhuǎn)錄的流程就只能給大家稍微做一些簡(jiǎn)要介紹了,。
我想跟大家介紹一下我們當(dāng)前所做的工作和研究。這個(gè)研究我們把它叫做Myt1l,,通過(guò)我們神經(jīng)元的流程有一個(gè)過(guò)程,,這個(gè)過(guò)程是對(duì)非神經(jīng)元程序的抑制,我們發(fā)現(xiàn)他們通過(guò)配合能夠形成更好的效果,,他們可以更加有效地開發(fā)并且關(guān)閉神經(jīng)元的程序,,也有相應(yīng)神經(jīng)元負(fù)責(zé)不同的基因,。比如說(shuō)對(duì)部分神經(jīng)元的編輯。跟大家強(qiáng)調(diào)一下,,我們當(dāng)前所看到的一些主要結(jié)論:
IPS細(xì)胞是如何運(yùn)作的,?大家比較熟悉,有各種不同的類型,。為了強(qiáng)調(diào)它們之間的差別,,我想跟大家談一下,最近所發(fā)布的一些資料當(dāng)中設(shè)計(jì)出來(lái)的信息,,可以看到這兩者之間的機(jī)理是有多大的差異,。這個(gè)表當(dāng)然有很多的數(shù)字,我會(huì)花一些時(shí)間帶著大家看一下,。這里主要是有四類不同的程序,,從左往右,首先是MES,,第二個(gè)是經(jīng)過(guò)48小時(shí),,經(jīng)過(guò)預(yù)先的處理的方式,最后是ESC的方式,。給大家展示的是,,如果EVs增加,那么這個(gè)增加就要求我們進(jìn)行一些更加詳細(xì)的分析,,有沒(méi)有出現(xiàn)一些特定的表達(dá),如果說(shuō)它確實(shí)快速地關(guān)閉了我們所需要的類型,,而且這個(gè)程序本身是需要能夠得到表達(dá)的,。
接下來(lái)考慮整個(gè)刺激的變化,確實(shí)會(huì)有一些變化的發(fā)生,,有一些是技術(shù)上是很好的,,可以測(cè)量和評(píng)估的,包括對(duì)于阻蛋白調(diào)節(jié)的變化,,這些變化需要很長(zhǎng)的時(shí)間累計(jì),,才能產(chǎn)生明顯的效果。
轉(zhuǎn)錄因子去哪里了,?我們有一些提升的因素,,這些因素當(dāng)然受了一些主要的推動(dòng)因素的影響,比如說(shuō)βB,,這一塊我們可以看到這個(gè)轉(zhuǎn)錄因子失去了它兼容性,,沒(méi)有辦法更加明顯地表現(xiàn)出來(lái)。如果說(shuō)我們現(xiàn)在去問(wèn)到底影響整個(gè)的編碼因素是什么,?我們通過(guò)觀察發(fā)現(xiàn),,這些再次編輯作用不是在初期所出現(xiàn)的,,而是有不同的變化呈現(xiàn),是有結(jié)合的,,最后得出來(lái)的結(jié)論是即使說(shuō)它可以引起轉(zhuǎn)錄因子的變化,,正是這樣的因素關(guān)閉了刺激的因素。這就花了非常長(zhǎng)的時(shí)間,,專門用相當(dāng)?shù)木M(jìn)一步探索到底是由哪些因素起到的作用,。我們的這種轉(zhuǎn)錄因素可以找到合適的目標(biāo),而且在這樣的纖維元細(xì)胞里面可以明確想要找到具體的基因序列是哪個(gè),。
我想進(jìn)一步地闡述這種機(jī)理的原理,。我們可以看到這種基因的序列的研究�,?梢詭�(lái)非常有趣的觀察,,調(diào)整出其中一個(gè)比較有趣的結(jié)論跟大家分享一下。
這里有100-120個(gè)左右的細(xì)胞,,從纖維元細(xì)胞到神經(jīng)元細(xì)胞,,基于它的基因表達(dá)相似之處,發(fā)現(xiàn)這個(gè)基因里面有這個(gè)曲線,,這就是一個(gè)重組的路徑,,另外兩個(gè)比較有趣的現(xiàn)象發(fā)生在這個(gè)重組路徑中,這些細(xì)胞他們之前所說(shuō)誘導(dǎo)神經(jīng)元細(xì)胞到神經(jīng)元細(xì)胞的過(guò)程,,跟原始路徑是截然不一樣的,,而且也是呈現(xiàn)出一種向下的曲線。這個(gè)五個(gè)細(xì)胞不能從下降的曲線,、下降的轉(zhuǎn)錄因素里面找到,。這里我們所說(shuō)的Ascl1,這幾個(gè)細(xì)胞形成一個(gè)大的群體,,很多細(xì)胞通過(guò)誘導(dǎo)產(chǎn)生,,可以用于我們的分析。因此,,Ascl1這些細(xì)胞他們可以產(chǎn)生出非常密集的趨勢(shì),,這些細(xì)胞可以非常有選擇性的進(jìn)行表達(dá),而且的它們呈現(xiàn)出比較統(tǒng)一的表達(dá)類型,。為了增強(qiáng)這一點(diǎn)我們也是在這個(gè)區(qū)域來(lái)分析纖維元細(xì)胞和神經(jīng)元的對(duì)比,。可以發(fā)現(xiàn)這些細(xì)胞是在原始項(xiàng)目里面誘導(dǎo)出來(lái),,某種情況下它們的細(xì)胞越來(lái)越多,,Ascl1是一個(gè)比較啟動(dòng)的因子,可以讓我們了解這樣一個(gè)基因序列的作用,,可以作為一種轉(zhuǎn)錄的啟動(dòng)因素,,因此我們就會(huì)思考Ascl1是否有一些深入化學(xué)的特性和肌肉有關(guān),、和神經(jīng)元有關(guān),在我們的研究過(guò)程中在我們的項(xiàng)目里面其實(shí)沒(méi)有發(fā)現(xiàn)這些具體的信息,,對(duì)于這樣一個(gè)體我們需要進(jìn)行不同研究,。思考一下MyoD和Ascl1的特點(diǎn),在神經(jīng)細(xì)胞里面把MyoD放到其中,,他們有相似的地方,。Ascl1可以誘導(dǎo)神經(jīng)元細(xì)胞,MyoD1可以誘導(dǎo)肌肉細(xì)胞,,這張圖中可以顯示出結(jié)果,。另外,在這個(gè)項(xiàng)目里面還可以發(fā)現(xiàn)這些Ascl1有關(guān)的序列是被激活的,,我們把這樣的兩個(gè)轉(zhuǎn)錄因素進(jìn)行具體的描述,,在纖維元細(xì)胞中如何進(jìn)行爭(zhēng)取的。我們來(lái)研究Ascl1和MyoD這些轉(zhuǎn)錄因素的相似之處,。在這些項(xiàng)目中它們有相同的整合方式,,盡管說(shuō)這種整合方式比較相似,這個(gè)轉(zhuǎn)錄根本上來(lái)說(shuō)是截然不一樣的,。因?yàn)樗墓δ苄允窍喾吹�,,從神�?jīng)元到纖維元細(xì)胞到肌肉細(xì)胞有不同的過(guò)程。
它們這種轉(zhuǎn)錄功能是不一樣的通過(guò)一定的數(shù)據(jù)分析之后,,我們需要看一下它的這種整合類型的數(shù)量,,從數(shù)量方面進(jìn)行考量。通常我們把這些數(shù)據(jù)進(jìn)行分層,、進(jìn)行分類,。還有它的這種結(jié)合的強(qiáng)度,從左邊可以看出這種結(jié)合的強(qiáng)度以及MyoD的關(guān)系,。這里是相反的圖譜,下面在這樣一個(gè)方式中可以看出H3一欄中,,我們可以看出Ascl1有很強(qiáng)的整合效果,,在這里它有一個(gè)增強(qiáng)的標(biāo)記,從數(shù)量角度來(lái)看MyoD的整合方式是比較強(qiáng)的,。另外還有一種方式來(lái)評(píng)估它的基因序列,,可以看出Ascl1以及MyoD基因表達(dá)的相關(guān)性。這可以幫助我們解開問(wèn)題的答案,。像我們之前所說(shuō)的,,Ascl1是和神經(jīng)元細(xì)胞以及肌肉細(xì)胞有關(guān),從MyoD的角度進(jìn)行考量,。我們可以看一下它的這種肌肉細(xì)胞和神經(jīng)元細(xì)胞的關(guān)系,,它的表達(dá)性可能說(shuō)不像MyoD表達(dá)性那么強(qiáng),,那么因此如何實(shí)現(xiàn)一種平衡,能夠把MyoD和Ascl1之間的基因表達(dá)進(jìn)行平衡,,能夠把這些神經(jīng)元進(jìn)行啟動(dòng),。有一種抑制劑,可以抑制這種肌肉細(xì)胞,,如果把MyoD和Ascl1進(jìn)行抑制的話形成這樣一個(gè)結(jié)果,。
用綠色表達(dá)這個(gè)肌肉細(xì)胞,可以看到一個(gè)更好細(xì)胞的產(chǎn)生,�,?梢钥吹組yoD有一個(gè)非常強(qiáng)的肌肉細(xì)胞表達(dá)。MyoD利用我們之前所說(shuō)的抑制器進(jìn)行研究,。哪些因素可以抑制MyoD的表達(dá),?可以看它的顏色以及之前的顏色是不一樣的。在這里可以看到它的形態(tài)學(xué),。所以,,可以改變這種平衡,改變不同項(xiàng)目的活動(dòng),,改變這些轉(zhuǎn)錄的抑制,,這樣的話我們可以達(dá)到自己想要的目標(biāo)。這是我要分享的內(nèi)容,,謝謝你們,。
這是我們的實(shí)驗(yàn)室,這是非�,?鞓�(lè)的一群人,,他們的名字在這屏幕上。我想,,還要感謝主辦方,,感謝支持機(jī)構(gòu)。謝謝,!